Một ngày nọ, một tác phẩm điêu khắc bằng đá mang hình dáng kỳ lạ giống Keroro đến chỗ của Fuyumi. Để giải quyết bí ẩn này, Biệt đội Keroro đi đến Đảo Phục Sinh bị cô lập và bí ẩn. Ở đó, họ gặp những linh hồn vô hại được gọi là Mana, và cặp song sinh kỳ lạ Io và Rana. Cuối cùng là Akuaku, một ác linh huyền thoại vừa được đánh thức sau giấc ngủ dài.